قيس در دوران امام على ( ع ) مهمترين فراززندگى قيس ، دوران امام على ( ع ) است او كه سراپا عشق ومحبّت به امام بود خود راوقف خدمت آن حضرت كرد و تا آخرين لحظات عمر امام درخدمت وى بود . درتمام معركه ها شركت كرد ورشادتها و دلاوريهاى چشمگير از خودنشان داده از جانب امام به استاندارى مصر و آذربايجان منصوب شد وباسياست وكاردانى كم نظير در مدت امارت خود ، امور آن ولايات را سرو سامان داد . مسؤليتّهاى قيس در دوران حكومت امام على ( ع ) عبارت بود از : 1 . عضو هيئت اعزامى به كوفه جهت بسيج مردم براى جنگ جمل 2 . فرماندهى قسمتى از پياده نظام درجنگ جمل 3 . فرماندهى قسمتى از جناح چپ لشكر درصفين 4 . فرماندهى سپاه براى جنگ بامعاويه دراواخر عمر حضرت امام على ( ع ) 5 . فرماندهى « شرطة الخميس » « 1 » 6 . استاندارى مصر 7 . استاندارى آذربايجان 8 . رياست انصار استاندارى مصر بعداز اينكه امام على ( ع ) به خلافت رسيد ، فرمانداران وحاكمان ولايات را منصوب كرد ، ازجمله قيس بن سعد رادرماه صفر سال 36 هجرى به استاندارى مصر برگزيد . « 2 »

--> ( 1 ) . نيروهاى ويژه وضربتى چند هزار نفرى كه همواره گوش به فرمان اميرالمؤمنين ( ع ) بودند ( اختصاص ، ص 2 ) ( 2 ) . كامل ، ج 2 ، ص 268 .